Bacteriologie

Le laboratoire de bactériologie médicale s’occupe des examens cytobactériologiques des échantillons de produits biologiques des clients. Ces examens consistent à rechercher les agents pathogènes (bactéries ou champignons microscopiques) éventuellement présents dans les produits biologiques. Divers types d’échantillons sont couramment analysés en routine ou dans le cadre de la surveillance épidémiologique.

Le laboratoire assure également l’encadrement des stagiaires des écoles de formation nationales et internationales. Il  participe à l’animation de la vie scientifique de l’institut par des publications de manuscrits et des communications scientifiques au niveau national et international.

Le laboratoire va commencer la recherche de Campylobacter dans les selles dans un futur très proche.

v Examens réalisés en routine

Il s’agit des examens cytobactériologiques des échantillons biologiques ci-après :

-         urines (ECBU)

-         prélèvements Vaginaux (PV)

-         prélèvement Urétral (PU)

-         selles (Coproculture)

-         curetage urétral (CU)

-         pus, liquides de ponction, liquides articulaires, liquides de lavage broncho-alvéolaires, liquides d’ascite, etc…….

-         expectorations (crachats)

-         secrétions au niveau du sinus (prélèvement nasal)

-         lésions de la gorge (prélèvement de gorge)

-         urines (Culot urinaire)

-         urines (Hématurie-Leucocyturie-Minutes (HLM))

Le laboratoire réalise également les frottis cervico vaginaux (FCV) pour le dépistage des lésions pré-cancéreuses ou malignes.

v Activités de surveillance

Le laboratoire participe à la surveillance des maladies à potentiel épidémique (MPE), à savoir les méningites bactériennes (Examen Cytobactériologique du Liquide cérébrospinal) et les maladies diarrhéiques (choléra, salmonellose et shigellose).

v Programme de contrôle qualité

-         Le laboratoire organise un programme de contrôle qualité à l’endroit des laboratoires du réseau national des laboratoires pour la surveillance des MPE en leur soumettant des lames préparées pour la reconnaissance des germes méningés et entériques au microscope.

-         Le laboratoire organise des formations pratiques et des supervisions formatives à l’endroit des laboratoires du réseau dans le cadre de la surveillance des MPE.

-         Le laboratoire, avec l’appui des partenaires (OMS, CDC), renforce le plateau technique des autres laboratoires du réseau en réactifs, consommables et en équipements (microscopes, autoclaves, poste de sécurité microbiologique : PSM…) pour le diagnostic biologique des MPE.

Intérêt des analyses du laboratoire

-         les examens de la bactériologie permettent de rechercher et identifier la ou les bactéries en cause dans une maladie infectieuse ou responsable(s) d’une épidémie.

-         le laboratoire réalise des tests de sensibilité des bactéries aux antibiotiques afin d’orienter les cliniciens dans leur choix des antibiotiques et contribuer à la surveillance de la résistance aux antimicrobiens.

Le FCV va permettre de rechercher et identifier les cellules atypiques pré-cancéreuses ou malignes au niveau du col utérin.

Compétences et qualification du personnel du laboratoire :

Le laboratoire compte 13 agents dont des Ingénieurs de travaux biologiques, des Techniciens supérieurs de laboratoire, un aide laboratoire et un médecin biologiste et épidémiologiste qui coordonne les activités en tant que chef de laboratoire. Le personnel est qualifié et habileté aux différentes tâches du laboratoire.

Les jours et heures de prélèvement ou de prestation

Le laboratoire réalise ces prélèvements et reçoit les prélèvements externes de lundi à jeudi, de 7H00 à 10H00.

Exceptionnellement, sur accord du laboratoire, certains prélèvements urgents peuvent être reçus au-delà de 10H00 ou le vendredi.

NB : les culots urinaires et le test d’HLM sont recevables de lundi à vendredi de 7H00 à 10H00.

Délai de rendue des résultats d’analyses

-         Le délai d’attente des résultats est de 3 ou 4jours en fonction des examens ;

-         Pour les culots urinaires et HLM, les résultats sont disponibles le même jour dans l’après-midi.

Contact du laboratoire/ service (mail et ou téléphone)

Contactez le laboratoire de bactériologie au numéro du standard 22 21 06 33

Quelques productions scientifiques du Laboratoire de Bactériologie

• Présentations aux congrès scientifiques

Présentation de deux abstracts (une communication orale et un poster) à la 22^ème conférence internationale sur les Neisseria pathogènes à Cape Town, Afrique du Sud du 09-14 octobre 2022 :

The epidemiology of bacterial meningitis in four northern regions of Togo, 2016-2019;

Evaluation of field performance of latex agglutination tests in laboratory diagnosis of Neisseria meningitidis serogroups C, W and Streptococcus pneumoniae meningitis in four northern regions, Togo, 2016-2019;

Présentation de deux abstracts au 1er Congrès burkinabè de Santé Publique à l’Université Joseph Ki-Zerbo, Ouagadougou, 19-21 décembre 2019 :

Évolution de la prévalence des Staphylococcus aureus résistants à la méticilline isolées à l’Institut National d’Hygiène, Lomé, Togo, 2011-2017 ;

Évolution de la résistance aux antibiotiques des Enterobacteriaceae isolés à l’Institut National d’Hygiène, Lomé, Togo, 2010-2017.

Présentation d’un abstract au Congrès de la Société Ivoirienne de Parasitologie et de Mycologie (SIPAM), Université de Cocody, 09-10 mars 2016 ;  

Profil des espèces levuriformes dans les mycoses cutanéo-muqueuses et leur sensibilité aux antifongiques dans deux structures de laboratoire de Lomé (Togo), SIPAM Mars 2016

• Publications de manuscrits scientifiques

-         Diagbouga S, Salah FD, Sadji AY, Dabire AM, Nadembega C, et al. (2016) Detection of High Prevalence of TEM/SHV/CTX-M Genes in ESBL Producing and Multidrug Resistant Klebsiella Pneumoniae and Klebsiella Oxytoca. J Clin Diagn Res 4: 130.

-         Fortune Djimabi Salah, Adodo Yao Sadji, Koffi Akolly, Bawimodom Bidjada, Koffi Somenou Awoussi et al. Augmentation de la résistance aux antibiotiques des Entérobactéries isolées à l’Institut National d’Hygiène de Lomé de 2010 à 2017.

-         Alicia R. Feagins*, Adodo Yao Sadji*, Nadav Topaz, Mark Itsko, Jacqueline Wemboo Afiwa Halatoko, Alessou Dzoka^. Neisseria meningitidis serogroup C clonal complex 10217 outbreak in West Kpendjal district, Togo– 2019.

-         Salah FD, Diagbouga S, Dabire MA, Sadji AY, Nadembega C, et al. First Detection of Resistance Genes Encoding Extended Spectrum β-Lactamase Producing Escherichia coli at Lomé, Togo. Arch Clin Microbiol. 2016, 7:6.

-         Salah FD, Diagbouga S, Ouattara A K, Sadji AY et al. Distribution of quinolone resistance gene (qnr) in ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella spp. in Lomé, Togo. Antimicrobial Resistance and Infection Control (2019) 8:104.

-         Moore S, Miwanda B, Sadji AY, ThefenneH, Jeddi F, Rebaudet S, et al. (2015) Relationship between Distinct African Cholera Epidemics Revealed via MLVA Haplotyping of 337 Vibrio cholerae Isolates. PLoS Negl Trop Dis 9(6): e0003817. doi: 10.1371/journal.pntd.0003817

-         Moore S, Dongdem AZ, Opare D, Cottavoz P, Fookes M, Sadji AY, et al. (2018). Dynamics of cholera epidemics from Benin to Mauritania. PLoS Negl Trop Dis 12(4): e0006379. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0006379

-         Mounkoro et al. Neisseria meningitidis Serogroup W Meningitis Epidemic in Togo, 2016. The Journal of Infectious Diseases « 2019; 220(S4): S216–24.

-         Passimna Pissang, Amégninou Agban, Yao Patrick Hoekou, Tchadjobo Tchacondo, Sadji Adodo Yao et al.  Evaluation In Vitro De L’activité Antimicrobienne Des Extraits De Cassia Alata Linn. (Fabaceae). European Scientific Journal July 2016 edition vol.12, No.21.