Les activités du laboratoire sont regroupées en trois domaines qui sont entre autres, Activités techniques, Interventions en biologie médicale, en santé publique et recherche et Formation. 

Les activités techniques couvrent :

−        les prélèvements de la matière biologique,

−        la collecte, la conservation et le transport jusqu’au laboratoire,

−        la détection des pathogènes par les techniques de biologie moléculaire et de séquençage,

−        la gestion des données et la communication des résultats

Les interventions

Ø  en biologie médicale consistent en la réalisation de la charge virale des Hépatites B et C, du VIH.

Ø  en santé publique consistent à la participation du laboratoire à la surveillance des maladies à potentiel épidémique (MPE) par la confirmation biologique des maladies sous surveillance et autres évènements d’urgence de santé publique de portée internationale.

Ces maladies sont :

ü  Maladies virales : Les grippes saisonnières (A/H1N1pdm09, A/H3N2, B/Yam/Vic), grippes aviaires hautement pathogènes (A/H5N1), autres grippes aviaires (A/H7N9, A/H3N2variant, etc…) ; la COVID-19 (SARS-CoV-2), les fièvres hémorragiques virales et arboviroses (Ebola, Lassa, Marburg, Crimée-Congo, Fièvre de la Vallée du Rift, Fièvre Jaune, Dengue, Chikungunya, Zika) ; les autres virus respiratoires (Rhinovirus, RSV, Métapneumovirus, Para Influenzavirus, les coronavirus saisonniers)

ü  Maladies bactériennes (Les méningites bactériennes aiguës, l’ulcère de Buruli, le Pian)

ü  Les maladies parasitaires (le paludisme, l’onchocercose)

Les interventions en recherche consistent en la recherche opérationnelle, et  sont des activités en lien avec la santé publique. Ces interventions sont conduites le plus souvent sous forme de projets financés par les partenaires techniques et financiers. Le laboratoire participe depuis 2011 à des projets de recherche sur les maladies notamment :

ü  Projet de financement du CDC pour maintenir la capacité de surveillance de routine de la grippe afin de détecter et de répondre à la grippe pandémique et de soutenir le développement des capacités pour répondre à d'autres épidémies de maladies infectieuses respiratoires, 2021-2026

ü  Projet de financement du CDC sur l'amélioration de la capacité à effectuer une surveillance de routine de la grippe et à détecter et à répondre à la grippe aviaire et pandémique, 2016-2021

ü  Programme de sécurité sanitaire mondiale (GHSA) du CDC sur le renforcement des capacités pour une surveillance en temps réel et une réponse rapide à Ebola, aux épidémies de maladies infectieuses ou d’urgences de santé publique de portée internationale, 2015-2018

ü  Projet BuruliVac pour la recherche de candidats vaccins contre l'infection à Mycobacterium ulcerans au Togo (Ulcère de Buruli), 2011-2013

ü  Les missions d’investigations des flambées ou d’épidémies.

Formation

Les acteurs de la surveillance et les techniciens de laboratoire sont formés dans les thématiques suivantes :

–        Les techniques de prélèvement du matériel biologique

–        La conservation, et le convoyage à partir des triples emballages

–        La technique d’emballage en utilisant les triples emballages homologués de l’OMS (UN3373 et UN2814)

–        La technique de décontamination pour les prélèvements hautement pathogènes

–        L’utilisation des enceintes de sécurité microbiologique (le Glove boxe, le PSM)

–        La détection du SARS-COV-2 en utilisant les techniques de biologie moléculaire (extraction d’ARN, préparation de milieu réactionnel, amplification génique PCR)

Intérêt des analyses du laboratoire/ service (pourquoi faire et à quoi sert des analyses qu’effectue le laboratoire) :

Les analyses du laboratoire contribuent à :

−        La surveillance des maladies à potentiel épidémique (MPE) dans toutes les étapes depuis la détection, la prise en charge et la riposte

−        La réalisation des analyses de biologie médicale pour la prise en charge efficace des patients pour les hépatites virales et le VIH.

Compétences et qualification du personnel du laboratoire/service :

Le personnel est composé de personnel avec les qualifications suivantes :

-          Biologistes PhD,

-          Médecins Biologites

-          Ingénieurs biologistes,

-          Techniciens supérieurs de laboratoire

-          Personnel d’appui.

Le personnel est formé régulièrement et les compétences acquises sont dans les domaines suivants :

−        Le prélèvement du matériel biologique

−        La collecte, la conservation et le transport des prélèvements jusqu’au laboratoire

−        La réalisation des analyses par les techniques de biologie moléculaire

−        La gestion des données

−        Le management de la qualité

−        La gestion de la Biosécurité et la Biosûreté

Les jours et heures de prélèvement ou de prestation

-          Les prélèvements pour la réalisation des analyses de charge virale sont faits de 7H-11H de lundi à vendredi.

-          Les prélèvements dans le cadre de la surveillance des MPE sont reçus tous les jours de lundi à vendredi de 7H-17H.

Des dispositions sont prises pour réceptionner les échantillons au-delà des heures de travail, les week-ends ou les jours fériés.

Délai d’attente des résultats d’analyses :

−        Les résultats pour les analyses de charge virale sont remis aux patients sur rendez-vous.

−        Les résultats dans le cadre de la surveillance des MPE sont envoyés dès que possible dans les 24 heures suivant le prélèvement.

Contact du laboratoire/ service (mail et ou téléphone)

-          Chef service : Dr MAMAN Issaka, Tel : +22890137470                                      E-mail : mamanissaka@yahoo.fr

-          Surveillant du laboratoire : Dr SALAH Djimabi A. E. Fortune ;                            Tél.: +22890374137 ; E-mail. : fortunedavi@yahoo.fr

-          Correspondant qualité : Mlle TETTEKPOE H. Micheline, Tél. :+22893234246 ; E-mail. : michelinhom@gmail.com

-          Correspondant Biosécurité-Biosûreté : Mlle KOUMA Eninam ; Tél.+22891527062, E-mail. : eninam29@gmail.com

Le laboratoire de sérologie réalise des tests visant à déterminer la présence actuelle ou ancienne d’une infection par un microorganisme via l’étude du sérum et de ce qu'ils contiennent, notamment des anticorps spécifiques pouvant être liés à certains agents pathogènes (principalement, les bactéries et les virus, parfois aussi les parasites).  La sérologie (le laboratoire) jouera alors un rôle majeur dans l'analyse et l'interprétation des résultats et l'établissement d'un bilan, qu'il transmettra au clinicien. Cela aidera ainsi ce dernier, médecin généraliste ou spécialiste, à établir son diagnostic.

Le portefeuille d'analyse comprend des tests dans les domaines suivants :

-          Les infections congénitales (Toxoplasma gondii, virus de la rubéole) ;

-          Infections sexuellement transmissibles : VIH, Syphilis

-          Infections hépatiques :

Le laboratoire a une expertise particulière dans le diagnostic des Maladies à Potentiel Epidémique (MPE)

-          Recherche des IgM de la Fièvre Jaune

-          Recherche des IgM de la Rougeole

Intérêt des analyses du laboratoire

La sérologie permet de déterminer le statut immunitaire d'un individu vis-à-vis d'une infection, c'est-à-dire de savoir s'il est protégé contre une infection capable d'induire une immunité ou, dans certains cas, de savoir s'il est infecté par un pathogène susceptible d'induire une infection chronique ou inapparente. La sérologie virale permet également de dater une infection. 

Compétences et qualification du personnel du laboratoire

Le laboratoire dispose d’un personnel compétent et qualifié. Il dispose des techniciens, d’un ingénieur biologiste, d’un master. Tous les opérateurs sont formés.

Jours  et heures de prélèvement ou de prestation

Lundi-vendredi : 7H30-12H00

                            14H30-17H30

Délai d’attente des résultats d’analyses :

Les résultats sont disponibles 24h après le prélèvement pour les examens manipulés sur les automates. Les examens réalisés par ELISA sont disponibles comme suit :

Contact du laboratoire

Numéro de téléphone du labo : 93 74 26 61

Autres informations

Les examens comme D-Dimères, NT PROBNP, Troponine sont réalisés dans les 2 heures suivant le prélèvement et les résultats disponibles dès que possible. A défaut, les résultats sont disponibles le jour même.

Le laboratoire de bactériologie médicale s’occupe des examens cytobactériologiques des échantillons de produits biologiques des clients. Ces examens consistent à rechercher les agents pathogènes (bactéries ou champignons microscopiques) éventuellement présents dans les produits biologiques. Divers types d’échantillons sont couramment analysés en routine ou dans le cadre de la surveillance épidémiologique.

Le laboratoire assure également l’encadrement des stagiaires des écoles de formation nationales et internationales. Il  participe à l’animation de la vie scientifique de l’institut par des publications de manuscrits et des communications scientifiques au niveau national et international.

Le laboratoire va commencer la recherche de Campylobacter dans les selles dans un futur très proche.

v Examens réalisés en routine

Il s’agit des examens cytobactériologiques des échantillons biologiques ci-après :

-         urines (ECBU)

-         prélèvements Vaginaux (PV)

-         prélèvement Urétral (PU)

-         selles (Coproculture)

-         curetage urétral (CU)

-         pus, liquides de ponction, liquides articulaires, liquides de lavage broncho-alvéolaires, liquides d’ascite, etc…….

-         expectorations (crachats)

-         secrétions au niveau du sinus (prélèvement nasal)

-         lésions de la gorge (prélèvement de gorge)

-         urines (Culot urinaire)

-         urines (Hématurie-Leucocyturie-Minutes (HLM))

Le laboratoire réalise également les frottis cervico vaginaux (FCV) pour le dépistage des lésions pré-cancéreuses ou malignes.

v Activités de surveillance

Le laboratoire participe à la surveillance des maladies à potentiel épidémique (MPE), à savoir les méningites bactériennes (Examen Cytobactériologique du Liquide cérébrospinal) et les maladies diarrhéiques (choléra, salmonellose et shigellose).

v Programme de contrôle qualité

-         Le laboratoire organise un programme de contrôle qualité à l’endroit des laboratoires du réseau national des laboratoires pour la surveillance des MPE en leur soumettant des lames préparées pour la reconnaissance des germes méningés et entériques au microscope.

-         Le laboratoire organise des formations pratiques et des supervisions formatives à l’endroit des laboratoires du réseau dans le cadre de la surveillance des MPE.

-         Le laboratoire, avec l’appui des partenaires (OMS, CDC), renforce le plateau technique des autres laboratoires du réseau en réactifs, consommables et en équipements (microscopes, autoclaves, poste de sécurité microbiologique : PSM…) pour le diagnostic biologique des MPE.

Intérêt des analyses du laboratoire

-         les examens de la bactériologie permettent de rechercher et identifier la ou les bactéries en cause dans une maladie infectieuse ou responsable(s) d’une épidémie.

-         le laboratoire réalise des tests de sensibilité des bactéries aux antibiotiques afin d’orienter les cliniciens dans leur choix des antibiotiques et contribuer à la surveillance de la résistance aux antimicrobiens.

Le FCV va permettre de rechercher et identifier les cellules atypiques pré-cancéreuses ou malignes au niveau du col utérin.

Compétences et qualification du personnel du laboratoire :

Le laboratoire compte 13 agents dont des Ingénieurs de travaux biologiques, des Techniciens supérieurs de laboratoire, un aide laboratoire et un médecin biologiste et épidémiologiste qui coordonne les activités en tant que chef de laboratoire. Le personnel est qualifié et habileté aux différentes tâches du laboratoire.

Les jours et heures de prélèvement ou de prestation

Le laboratoire réalise ces prélèvements et reçoit les prélèvements externes de lundi à jeudi, de 7H00 à 10H00.

Exceptionnellement, sur accord du laboratoire, certains prélèvements urgents peuvent être reçus au-delà de 10H00 ou le vendredi.

NB : les culots urinaires et le test d’HLM sont recevables de lundi à vendredi de 7H00 à 10H00.

Délai de rendue des résultats d’analyses

-         Le délai d’attente des résultats est de 3 ou 4jours en fonction des examens ;

-         Pour les culots urinaires et HLM, les résultats sont disponibles le même jour dans l’après-midi.

Contact du laboratoire/ service (mail et ou téléphone)

Contactez le laboratoire de bactériologie au numéro du standard 22 21 06 33

Quelques productions scientifiques du Laboratoire de Bactériologie

• Présentations aux congrès scientifiques

Présentation de deux abstracts (une communication orale et un poster) à la 22^ème conférence internationale sur les Neisseria pathogènes à Cape Town, Afrique du Sud du 09-14 octobre 2022 :

The epidemiology of bacterial meningitis in four northern regions of Togo, 2016-2019;

Evaluation of field performance of latex agglutination tests in laboratory diagnosis of Neisseria meningitidis serogroups C, W and Streptococcus pneumoniae meningitis in four northern regions, Togo, 2016-2019;

Présentation de deux abstracts au 1er Congrès burkinabè de Santé Publique à l’Université Joseph Ki-Zerbo, Ouagadougou, 19-21 décembre 2019 :

Évolution de la prévalence des Staphylococcus aureus résistants à la méticilline isolées à l’Institut National d’Hygiène, Lomé, Togo, 2011-2017 ;

Évolution de la résistance aux antibiotiques des Enterobacteriaceae isolés à l’Institut National d’Hygiène, Lomé, Togo, 2010-2017.

Présentation d’un abstract au Congrès de la Société Ivoirienne de Parasitologie et de Mycologie (SIPAM), Université de Cocody, 09-10 mars 2016 ;  

Profil des espèces levuriformes dans les mycoses cutanéo-muqueuses et leur sensibilité aux antifongiques dans deux structures de laboratoire de Lomé (Togo), SIPAM Mars 2016

• Publications de manuscrits scientifiques

-         Diagbouga S, Salah FD, Sadji AY, Dabire AM, Nadembega C, et al. (2016) Detection of High Prevalence of TEM/SHV/CTX-M Genes in ESBL Producing and Multidrug Resistant Klebsiella Pneumoniae and Klebsiella Oxytoca. J Clin Diagn Res 4: 130.

-         Fortune Djimabi Salah, Adodo Yao Sadji, Koffi Akolly, Bawimodom Bidjada, Koffi Somenou Awoussi et al. Augmentation de la résistance aux antibiotiques des Entérobactéries isolées à l’Institut National d’Hygiène de Lomé de 2010 à 2017.

-         Alicia R. Feagins*, Adodo Yao Sadji*, Nadav Topaz, Mark Itsko, Jacqueline Wemboo Afiwa Halatoko, Alessou Dzoka^. Neisseria meningitidis serogroup C clonal complex 10217 outbreak in West Kpendjal district, Togo– 2019.

-         Salah FD, Diagbouga S, Dabire MA, Sadji AY, Nadembega C, et al. First Detection of Resistance Genes Encoding Extended Spectrum β-Lactamase Producing Escherichia coli at Lomé, Togo. Arch Clin Microbiol. 2016, 7:6.

-         Salah FD, Diagbouga S, Ouattara A K, Sadji AY et al. Distribution of quinolone resistance gene (qnr) in ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella spp. in Lomé, Togo. Antimicrobial Resistance and Infection Control (2019) 8:104.

-         Moore S, Miwanda B, Sadji AY, ThefenneH, Jeddi F, Rebaudet S, et al. (2015) Relationship between Distinct African Cholera Epidemics Revealed via MLVA Haplotyping of 337 Vibrio cholerae Isolates. PLoS Negl Trop Dis 9(6): e0003817. doi: 10.1371/journal.pntd.0003817

-         Moore S, Dongdem AZ, Opare D, Cottavoz P, Fookes M, Sadji AY, et al. (2018). Dynamics of cholera epidemics from Benin to Mauritania. PLoS Negl Trop Dis 12(4): e0006379. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0006379

-         Mounkoro et al. Neisseria meningitidis Serogroup W Meningitis Epidemic in Togo, 2016. The Journal of Infectious Diseases « 2019; 220(S4): S216–24.

-         Passimna Pissang, Amégninou Agban, Yao Patrick Hoekou, Tchadjobo Tchacondo, Sadji Adodo Yao et al.  Evaluation In Vitro De L’activité Antimicrobienne Des Extraits De Cassia Alata Linn. (Fabaceae). European Scientific Journal July 2016 edition vol.12, No.21.

Le laboratoire de chimie de l’eau et de produits relève du département de l’Hygiène Appliquée de l’INH. C’est le laboratoire. C’est le laboratoire national en matière de contrôle qualité de l’eau au Togo. Il participe aux actions de santé publique.

Le laboratoire a une ambition de d’élargir la gamme de paramètres de recherche. A cet effet, plus équipements sont en voie d’équipement : le Spectrophotomètre d’absorption atomique (SAA), la chromatographique en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse, la Spectrométrie de Masse à plasma induit, etc.

Rôles :

-         Assure le contrôle qualité de l’eau à travers l’évaluation des risques chimiques et toxicologiques

-         Analyse la qualité de l’environnement pour protéger la population contrôle des risques

-         Participe au contrôle qualité de l’eau afin de permettre l’octroi d’agrément de mise sur le marché aux sociétés productrices de l’eau

-         Participe aux enquêtes et évaluation de la qualité de l’eau sur toute l’étendue du territoire national

-         Encadre des étudiants des universités et école de formations de sciences de l’eau

-         Participe à la formation des étudiants dans les écoles et universités de sciences de l’eau

-         Réalise des recherches en sciences de l’eau

Produits analysés : eau de consommation, eaux usées, échantillons d’environnement, produits divers

Intérêt des analyses du laboratoire

-         Vérification de la qualité de l’eau par rapport aux recommandations de l’OMS pour la consommation humaine afin de prévenir l’exposition des substances toxiques

-         Vérification de la qualité des eaux usées afin de connaitre le niveau de contamination et évaluation de risque

-         Vérification de paramètres de qualité des effluents traités afin d’apprécier les performances de traitement d’une station de traitement des eaux usées

-         Vérification de paramètres de qualité des effluents traités par rapport aux critères de rejet dans l’environnement

Compétences et qualification du personnel du laboratoire

Les travaux d’analyse au laboratoire sont assurés par un personnel qualifié et qui participe à des formations continues. Il est composé de :

-         un Docteur en chimie de l’eau (PhD)

-         6 Ingénieurs en chimie

-         7 technicien Supérieurs (Licence) en chimie

Le laboratoire est inscrit dans la démarche qualité et est soumis régulièrement à des audits internes régulièrement réalisés couronnés par une revue de direction à mi-parcours et finale à la fin de chaque année.

Aussi des contrôles qualités sont organisés à travers la participation à des inter comparaisons de laboratoires notamment de BIPEA.

Jours  et heures de prélèvement ou de prestation

Le laboratoire s’ouvre de Lundi à vendredi

Heure : 7h00 - 12h00 puis 14H30 - 17h30

Délai d’attente des résultats d’analyses :

Le délai d’attente pour le retrait des résultats varie en fonction des paramètres à rechercher. Pour l’analyse de l’eau de boisson, deux à trois sont suffisants.